Seit Bestehen des München Marathon leistet die Veranstaltung jedes Jahr einen Beitrag für soziale Projekte in und um München. So wurde beispielsweise im Jahr 2015 das Programm „Laufend integrieren“ zur Integration von Flüchtlingen auf die Beine gestellt, welches im Jahr 2017 von der „Association of International Marathons and Distance Races“ mit dem „Social Award 2017“ ausgezeichnet wurde. 2021 gilt es das Projekt „Lauf dich fit“ des Bayerischen Leichtathletik Verbands (BLV e.V.) zu fördern.
Um dieses Engagement nun auf eine professionelle Ebene zu heben, wurde im Jahr 2020 die GEMEINNÜTZIGE MÜNCHEN MARATHON STIFTUNG ins Leben gerufen. Die Stiftung hat es sich zur Aufgabe gemacht ihren Beitrag für ein sportliches und gerechtes München zu leisten sowie lokale und regionale Projekte zu unterstützen.

