Die Oberlinstiftung wurde im Juni 2002 von dem Verein Oberlinhaus gegründet. Sie wurde mit dem Ziel errichtet, das Oberlinhaus in seinen Aufgaben, Leistungen und innovativen Projekten wirkungsvoll und langfristig zu fördern. Dieser Aufgabe kommt die Stiftung vor allem dort nach, wo keine oder nicht ausreichend öffentliche Mittel zur Verfügung stehen. Die Oberlinstiftung ist Mitglied im Bundesverband Deutscher Stiftungen und bekennt sich zu den Grundsätzen guter kirchlicher Stiftungspraxis